据2009年《新编诸子集成续编丛书 出版者言》称，“丛书原拟分两辑出版，第一辑拟目三十多种，后经过调整，确定为四十种，今年将全部出齐。第二辑原来只有一个比较笼统的规划，受各种因素限制，在实施过程中不断发生变化，有的项目已经列入第一辑出版，因此我们后来不再使用第一辑的提法，而是统名之为新编诸子集成。”[2]
以下为该辑书目。“首版出版时间”指该书中华书局第一版出版时间。有些图书首版出版于收入本集成前，后被中华书局收入本集成，但其首版仍为原首版出版时间，并列印于版权页上，故下表相应注明“收入集成时间”。
编号
书名
作者
点校/整理者
首版出版时间
备注
收入集成时间
1
论语集释
程树德撰
程俊英 蒋见元点校
1990年
全4册
2
孟子正义
焦循撰
沈文倬点校
1987年
全2册
1991年
3
四书章句集注
朱熹撰
钟哲点校
1983年
4
荀子集解
王先谦撰
沈啸寰 王星贤点校
1988年
全2册
5
墨子间诂
孙诒让撰
孙以楷点校
1986年
全2册
孙启治点校
2001年
全2册
6
墨子校注
吴毓江撰
孙启治点校
1993年
7
墨辩发微
谭戒甫撰
1964年
1986年
8
墨子城守各篇简注
岑仲勉撰
1958年
1986年
9
老子道德经注
王弼撰
楼宇烈校释
2008年
10
老子校释
朱谦之撰
1963年
1983年
11
帛书老子校注
高明撰
1996年
12
庄子集释
郭庆藩撰
王孝鱼点校
1961年
全4册
1982年
13
庄子集解
王先谦撰
沈啸寰点校
1987年
庄子集解内篇补正
刘武撰
沈啸寰点校
14
列子集释
杨伯峻撰
1979年
1985年
15
管子校注
黎翔凤撰
梁运华整理
2004年
全3册
16
管子轻重篇新诠
马非百撰
1979年
全2册
1986年
17
商君书锥指
蒋礼鸿撰
1986年
18
韩非子集解
王先慎撰
钟哲点校
1998年
19
公孙龙子悬解
王琯撰
1992年
20
公孙龙子形名发微
谭戒甫撰
1963年
1986年
21
十一家注孙子校理
孙武 撰 曹操等 注杨丙安 校理
1999年
22
吕氏春秋集释
许维遹撰
梁运华整理
2009年
23
晏子春秋集释
吴则虞撰
1962年
全2册
1982年
24
孙膑兵法校理
张震泽撰
1984年
1986年
25
新语校注
陆贾撰 王利器校注
1986年
26
新书校注
贾谊撰 阎振益 钟夏 校注
2000年
27
淮南鸿烈集解
刘文典撰
冯逸 乔华 点校
1989年
全2册
28
淮南子集释
何宁撰
1998年
全3册
29
盐铁论校注（定本）
王利器撰
1992年
全2册
30
春秋繁露义证
苏舆撰
钟哲 点校
1992年
31
法言义疏
汪荣宝撰
陈仲夫 点校
1987年
全2册
32
太玄集注
扬雄 撰 司马光 集注
刘韶军 点校
1998年
33
白虎通疏证
陈立撰
吴则虞 点校
1994年
全2册
34
潜夫论笺校正
王符 撰 汪继培 笺 彭铎 校正
1985年
35
论衡校释（附刘盼遂集解）
黄晖撰
1990年
全4册
36
抱朴子内篇校释（增订本）
王明著
1980年
1985年
37
抱朴子外篇校笺
杨明照撰
1991年（上）1997年（下）
全2册
38
颜氏家训集解
王利器撰
1993年
39
文子疏义
王利器撰
2000年
40
刘子校释
刘昼著傅亚庶 校释
1998年